Le diagnostic de COVID-19 par PCR est-il précis

Yasser Mufeed Abdul Latif Zaher Al-Janabi 

Doctorat en pathologie, microbiologie et immunologieTout le monde s'étonne du retour d'un résultat de test de dépistage du virus Corona négatif alors que les signes cliniques sont présents. La première chose qui traverse l'esprit du patient est soit que la méthode de prélèvement était incorrecte, soit qu'une erreur s'est produite lors de l'analyse, soit qu'il y a eu manipulation ou négligence dans les noms.

Oui, cela peut arriver, mais le taux d'erreur est inférieur à 5 % car la cavité nasale et buccale est contaminée par des millions de virus en cas d'infection réelle, et le prélèvement est effectué en profondeur dans la cavité nasale et buccale. Il est donc très difficile, en cas d'infection, d'obtenir un prélèvement non contaminé par le virus, et le nom du patient est noté sur le prélèvement et la référence par écrit et par numéro, et de nombreuses informations sont collectées avant de prélever l'échantillon du patient. Cela réduit la probabilité d'erreur.

Il existe de nombreuses autres raisons pour lesquelles le résultat du prélèvement peut être négatif alors que des signes cliniques de la maladie apparaissent:

1.     Il existe sept types "genres" de coronavirus qui peuvent provoquer un syndrome de détresse respiratoire aigu et qui sont actuellement présents dans l'air HCoV-229E, HCoV-NL63, HCoV-HKU1, HCoV-OC43, SARS-CoV-2, SARS-CoV, MERS-CoV. Mais le plus répandu est SARS COV-19 Comme indiqué dans le tableau ci-joint. Les coronavirus qui infectent le système respiratoire et les poumons existent depuis 1965 et nous partageons les infections avec les chauves-souris et certains animaux.

·        HCoV-229E Ce virus a été découvert en 1965 et est responsable des infections de rhume, mais peut évoluer vers une bronchite en cas d'association avec un autre virus. Les infections sont saisonnières et la plupart des personnes infectées sont des enfants. Les chauves-souris partagent l'infection avec l'homme.

·        HCoV-NL63 Ce virus a été découvert à la fin de 2004 chez des enfants aux Pays-Bas et provoque une bronchite, attaquant les mêmes cellules que celles attaquées par SARS-CoV-2 Il a été établi qu'il se propage mondialement comme cause de rhume chez les adultes et de syndrome de détresse respiratoire aigu chez les enfants et les personnes âgées, et les chauves-souris partagent l'infection avec l'homme.

·        HCoV-HKU1La première découverte de ce virus a eu lieu avec le SRAS à Hong Kong en janvier 2004 et sa propagation mondiale a été confirmée. La plupart des infections sont des rhumes légers, mais elles peuvent atteindre le syndrome de détresse respiratoire aigu chez les personnes âgées. Les rats partagent l'infection avec l'homme.

·        HCoV-OC43Ce virus peut infecter les humains, les vaches et le bétail, il a été découvert au début de 2004 et sa propagation mondiale a été confirmée. Il diffère de SARS-CoV-2 par le type de récepteurs présents sur les cellules infectées. La plupart des infections sont des rhumes, mais cela peut conduire à un syndrome de détresse respiratoire aigu chez les personnes âgées et les nouveau-nés.

·        SARS-CoV Découvert en avril 2003 à Hong Kong, il ressemble à SARS-CoV-2 dans 90 % des gènes et la gravité des infections, mais sa capacité de propagation est moindre. Sa propagation mondiale a été confirmée. Il provoque un syndrome de détresse respiratoire aigu et infecte tous les âges, et les chauves-souris partagent l'infection avec l'homme.

·        MERS-CoV C'est un virus découvert en juin 2012 à Jeddah, en Arabie Saoudite, qui a fait de nombreuses victimes lors du pèlerinage et dans les pays arabes voisins. Des infections et des décès ont également eu lieu en Corée du Sud en 2015 et une seconde apparition a eu lieu en Arabie Saoudite en 2018. Les chameaux partagent l'infection avec l'homme, ce qui a conduit l'Organisation mondiale de la santé à concevoir un vaccin pour les chameaux afin de réduire la propagation du virus. Il provoque un syndrome de détresse respiratoire aigu chez tous les âges. Les chauves-souris partagent également l'infection avec les humains et les chameaux.

·         SARS-CoV-2C'est le virus le plus répandu parmi les humains à ce jour, qui est apparu dans un village voisin de la ville de Wuhan en Chine et non sur le marché de la ville, et à la fin de 2019, la présence du virus a été confirmée. Ce virus a une capacité élevée de propagation et de mutations génétiques, il est actuellement présent dans tous les pays du monde et plus de douze mutations ont été confirmées. Les dernières mutations du virus ont eu lieu en Inde, où trois mutations se sont produites à elles seules, et comme indiqué dans le tableau ci-joint, il y avait Delta Plus variant B.1.617.2.1 qui a augmenté la gravité de la propagation et de l'infection, et qui a été prouvée aux États-Unis, en Angleterre et dans de nombreux pays du monde. Le ministère de la santé irakien et l'Organisation mondiale de la santé n'ont pas confirmé l'existence de cette mutation du virus en Irak, et selon la déclaration du ministère de la santé irakien, la mutation présente est Alpha variant Beta (1.1.7) la mutation qui s'est produite en Grande-Bretagne.

L'homme et la chauve-souris partagent l'infection et provoquent un syndrome de détresse respiratoire aigu, touchant tous les âges.

2.     La conception du kit spécifique pour le virus SARS COV-19 a été réalisée par une université allemande "ni américaine ni chinoise" afin de réfuter la théorie du complot et a été bien accueillie par la communauté médicale européenne et l'Organisation mondiale de la santé, qui a déclaré que la précision du diagnostic se situe entre 70 et 93 %C'est aussi un autre facteur qui réduit le taux de résultats positifs. De plus, les entreprises fabriquant les kits de diagnostic ont varié dans le choix des gènes cibles du virus entre: E, protéine d'enveloppe de SARS-CoV-2 etN, protéine nucléocapside de SARS-CoV-2 etRdRp, ARN polymérase dépendante de l'ARN de SARS-CoV-2 etS, protéine spike de SARS-CoV-2. Cela contribue à la faiblesse du diagnostic car le virus est très mutable.

3.     Il a été observé que le virus ne peut pas être diagnostiqué dans les deux premiers jours ainsi que dans les derniers jours en utilisant l'un des kits de diagnostic, comme le montre l'image jointe, et cela constitue également un autre facteur qui réduit le taux de résultats positifs.

4.     Dans une recherche conjointe avec le professeur Dr. Haitham Naaman Al-Kubaisi que je mène actuellement, nous avons constaté la présence d'infections par des virus autres que le coronavirus, dont la plupart varient entre Influenza A H3, Adénovirus, Entérovirus & Rhinovirus ce qui entraîne l'apparition des mêmes symptômes que ceux du syndrome de détresse respiratoire aigu ou moins chez les patients. Tous ces points peuvent conduire à des résultats niant la présence du virus alors que le patient souffre d'un syndrome de détresse respiratoire aigu.